HBV-DNA是病毒的核心成分，是病毒復制及有傳染性的標志，是病毒感染的最直接、特異和靈敏指標。采用熒光定量 PCR 法病毒基因，既可以定性，又可以定量。

1、判斷傳染性的高低：若在常規體檢中發現HBsAg陽性，就必須檢查HBV-DNA以確定傳染性的高低。單純HBsAg陽性，HBV-DNA陰性，基本表明病毒無復制，傳染力很弱。

2、評價乙肝病毒攜帶者的疾病進展方向：乙肝病毒攜帶者若乙肝e抗原和HBV-DNA同為陰性，且ALT正常，稱為乙肝表面抗原攜帶者，則患者疾病進展緩慢或趨于靜止，不太容易出現肝癌或肝硬化，預后良好，一般不需要藥物治療。

乙肝病毒攜帶者若乙肝e抗原和HBV-DNA長期為陽性，則容易出現反復的肝功能異常，容易向肝硬化、肝癌發展，預后差，一般需要抗病毒治療。

3、用于判斷是否需要抗病毒治療：治療前進行HBV DNA定量檢測，根據病毒水平的高低結合ALT、肝臟疾病嚴重程度等，決定是否可以開始抗病毒治療。滿足抗病毒治療的HBV DNA水平如下：

“大三陽”慢乙肝（HBeAg陽性慢乙肝）：HBV DNA≥20 000IU/ml， “小三陽”慢乙肝（HBeAg陰性慢乙肝）：HBV DNA≥2000IU/ml。

5、評價藥物治療的療效：考察某種藥物治療乙肝是否有效，首先要觀察該藥對HBV-DNA的抑制作用。

· 抗病毒治療后HBV DNA快速下降并低于檢測下限，說明抗病毒治療療效好。

· 若抗病毒藥物治療半年后，HBV DNA雖然較治療前下降了1/100，但是仍然可以檢測到，需要注意是否有病毒學應答不佳（藥物療效不滿意），需要咨詢醫生是否及時調整治療。

需要注意的是抗病毒藥物并不能殺死乙肝病毒，只是抑制它的復制，由于肝細胞內共價閉合環狀DNA的存在，即使HBV-DNA已經轉陰，如果停用抗病毒藥物，仍有可能出現反跳，即HBV-DNA再次變為陽性。因此，抗病毒治療過程中不能只根據HBV-DNA水平決定是否停藥，而要綜合考慮各方面的因素，必須在專科醫生的指導下停藥，否則會導致治療失敗，甚至病情加重。

HBV感染是一個持續的、長期的過程。因此，血清HBV DNA載量的長期動態準確監測對于臨床治療至關重要。

為全面了解患者病情，尤其是乙肝五項定量結果低表達或經抗病毒治療后的患者，最好采用高靈敏系統檢測HBV DNA定量，如最低檢出限是